[[File:Allen_mg_2545-b.jpg|thumb|Ritratto di Fran Allen.]]
Allen è [[fellow]] dell'[[Institute of Electrical and Electronics Engineers|IEEE,]], dell'[[Association for Computing Machinery]] (ACM) e dal 2000 del [[Computer History Museum]] "per i suoi contributi all'ottimizzazione della programmazione e per la compilazione per comuputer paralleli"<ref>{{Cita web|url=http://www.computerhistory.org/fellowawards/hall/bios/Frances,Allen/|titolo=Frances Allen|editore=[[Computer History Museum]]|accesso=23 maggio 2013}}</ref>. Membro del Computer Science and Telecommunications Board, del Computer Research Associates (CRA) board e del [[National Science Foundation]]'s CISE Advisory Board, oltre che del [[National Academy of Engineering]] e dell'[[American Philosophical Society]].<sup class="noprint Inline-Template Template-Fact" style="white-space:nowrap;" contenteditable="false">[''<span title="This claim needs references to reliable sources. (November 2007)">citation needed</span>'']</sup> Fu inoltre eletta fellow dell'[[American Academy of Arts and Sciences]] nel 1994.<ref name="AAAS">{{Cita web|titolo=Book of Members, 1780–2010: Chapter A|url=http://www.amacad.org/publications/BookofMembers/ChapterA.pdf|editore=American Academy of Arts and Sciences|accesso=15 aprile 2011}}</ref>
Nel 1997, Allen fu inclusa nella hall of fame della fondazione Women in Technology International.<ref name="WITI">[http://www.witi.com/center/witimuseum/halloffame/1997/fallen.php WITI Hall of Fame]</ref>