Stem-loop: differenze tra le versioni

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Molti [[ribozimi]] sono dotati di strutture stem-loop. Il ''ribozima a testa di martello'' contiene tre stem-loops che si incontrano in una regione centrale non appaiata che funge da sito di clivaggio; questa struttura secondaria è indispensabile per il funzionamento di questo enzima. 

Nei [[procarioti]] ritroviamo anse a forcina all'interno della regione [[Untranslated region|5'UTR]]. Queste strutture sono spesso legate da proteine o sono fonte di una attenuazione dell'efficienza di traduzione, per cui hanno una attività regolatoria.<ref>{{citeCita journalpubblicazione|lastcognome=Meyer|firstnome=Michelle|author2autore2=Deiorio-Haggar K |author3autore3=Anthony J |titletitolo=RNA structures regulating ribosomal protein biosynthesis in bacilli|journalrivista=RNA BIology|datedata=July 2013|volume=10|seriesserie=7|pagespp=1160–1164|doi=10.4161/rna.24151|pmid=23611891|pmc=3849166}}</ref>

Lo stem-loop presente a livello della [[sequenza di Shine-Dalgarno]] funge da controllo dell'inizio della traduzione.<ref name=" doi: 10.1111/j.1365-2958.2009.06840.x">{{cite journalCita pubblicazione| author autore= Malys N, Nivinskas R | title titolo= Non-canonical RNA arrangement in T4-even phages: accommodated ribosome binding site at the gene 26-25 intercistronic junction |journal rivista= Mol Microbiol |volume = 73 | issue numero= 6 | pages pp= 1115–1127 | year anno= 2009 | pmid = 19708923 | doi =10.1111/j.1365-2958.2009.06840.x }}</ref><ref name=" doi: 10.1007/s00018-010-0588-z">{{cite journalCita pubblicazione| author autore= Malys N, McCarthy JEG | title titolo= Translation initiation: variations in the mechanism can be anticipated |journal rivista= Cellular and Molecular Life Sciences | year anno= 2010 | doi =10.1007/s00018-010-0588-z | pmid=21076851 | volume = 68 | issue numero= 6 | pages pp= 991–1003}}</ref>

E' anche importante citare l'utilità di questa struttura all'interno della terminazione rho-indipendente della trascrizione all'interno dei procarioti. La struttura stem-loop va a formarsi sulla sequenza di mRNA in fase di trascrizione e causa la dissociazione della [[RNA polimerasi]] dal filamento stampo. Questo processo prende il nome di terminazione rho-indipendente o terminazione intrinseca e la sequenza coinvolta prende il nome di [[Terminatore (biologia)|terminatore]]<nowiki/>.