Nel 1994 passa al Chievo, di cui diventa una bandiera e importante capitano. Nel 2001, dopo 7 lunghe stagioni nell'inferno della serie cadetta, il Chievo raggiunge l'ambita serie A. L'apice della carriera di Lorenzo coincide con il "periodo d'oro" del Chievo del presidente Campedelli, allenato da Luigi Del Neri (esordiente in serie A,2001). Lorenzo D'Anna, Luigi Del Neri, Bernardo Corradi, Simone Perrotta, Eugenio Corini, Nicola Legrottaglie, tra i tanti che si resero protagonisti dello splendido "fenomenoChievo", che a partire proprio dalla stagione 2001-2002 fino al 2004, stupì l'Italia intera, raggiungendo la partecipazione alla Coppa Uefa, attirando persino le attenzioni dei media europei. Contro ogni previsione, nell'agosto del 2007 D'Anna decide di porre fine alla sua grande avventura al Chievo, e lascia il piccolo quartiere di Verona.
Con la maglia gialloblu, Lorenzo ha collezionato 355 partite ufficiali e 17 reti tra serie A e serie B.
Nell'agosto del 2007, passa a titolo definitivo al Piacenza firmando un contratto annuale, con il difficile ruolo di "chioccia" per i tanti e promettenti giovani della squadra emiliana. A gennaio 2008 D' Anna rescinde il contratto con la squadra piacentina e firma con il Treviso