Il calice minore, nel rene, circonda l'apice della piramide del Malpighi. L'urina formatasi nel rene passa attraverso la papilla all'apice della piramide e raggiunge il calice minore, quindi passa nel calice maggiore.

La contrazione peristaltica della muscolatura liscia della parete dei calici, originata dalle cellule pace-maker, sospinge l'urina attraverso la pelvi e gli ureteri, fino alla vescica.