Orthocoronavirinae
L'orthocoronavirinae è una delle due sottofamiglie della famiglia dei Coronavirus. È suddivisa nei generi alphacoronavirus, betacoronavirus, gammacoronavirus e deltacoronavirus. Questi includono genogruppi filogeneticamente compatti di RNA avvolto, a senso positivo, a singolo filamento e con un nucleocapside di simmetria elicoidale. La dimensione genomica dei coronavirus varia da circa 26 a 32 kilobasi, straordinariamente grande per un virus a RNA. Il loro numero sta crescendo rapidamente con diversi nuovi coronavirus scoperti di recente, tra cui la sindrome respiratoria mediorientale MERS-CoV scoperta nel 2012.
| Orthocoronavirinae | |
|---|---|
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| Intervallo geologico | |
| Stato di conservazione | |
 Specie non valutata[1] | |
| Classificazione dei virus | |
| Dominio | Acytota |
| Gruppo | Virus a ssRNA+ (Gruppo IV - Virus a RNA a singolo filamento positivo) |
| Superphylum | Vira |
| Subphylum | Riboviria |
| Superclasse | Virus a ssRNA+ |
| Classe | Ribohelica |
| Ordine | Nidovirales |
| Sottordine | Cornidovirineae |
| Famiglia | Coronaviridae |
| Sottofamiglia | Orthocoronavirinae |
I generi
Il genere alphacoronavirus (precedentemente noto come gruppo 1 del Coronavirus (CoV-1)) comprende i sottogruppi 1a e 1b, che sono prototipati dal coronavirus umano 229E (HCoV-229E) e HCoV-NL63, nonché dalla nuova specie alphacoronavirus 1 (incluso virus della gastroenterite trasmissibile suina TGEV), rispettivamente. Il genere betacoronavirus (precedentemente betacoronavirus gruppo 2 (Cov-2)) comprende diversi sottogruppi, con i più importanti (sottogruppi 2a e 2b) prototipati dalla specie muron coronavirus (incluso il virus dell'epatite murina [MHV]) e la sindrome respiratoria acuta grave- coronavirus correlato, rispettivamente. Il genere alphacoronavirus e betacoronavirus derivano dal pool genico dei pipistrelli. Il genere gammacoronavirus comprende tutti i coronavirus aviari identificati fino al 2009.
Tassonomia
Questa sottofamiglia è composta da:[2]
- Alphacoronavirus
- Betacoronavirus
- Deltacoronavirus
- Gammacoronavirus
- Cegacovirus
- Igacovirus
- Avian coronavirus – type species
Note
- ^ (EN) Orthocoronavirinae, su IUCN Red List of Threatened Species, Versione 2020.2, IUCN, 2020.
- ^ (EN) Virus Taxonomy: 2018b Release, su International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), March 2019. URL consultato il 24 gennaio 2020.
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