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|colspan="3"| <small>Basato su: Williams ''et al.'', 2001<ref name="Williams">{{cita libro | autore=J. Williams ''et al.'' | anno=2001 | titolo=Biodiversity, Australia State of the Environment Report 2001 | url=https://web.archive.org/web/20110327235509/http://environment.gov.au/soe/2001/publications/theme-reports/biodiversity/pubs/biodiversity.pdf | editore=CSIRO Publishing on behalf of the Department of the Environment and Heritage | città=Canberra | isbn=0-643-06749-3}}</ref> e Chapman, 2009<ref>{{cita web | url=https://www.environment.gov.au/system/files/pages/2ee3f4a1-f130-465b-9c7a-79373680a067/files/nlsaw-2nd-complete.pdf | titolo=Numbers of Living Species in Australia and the World | autore=Arthur D. Chapman | data=settembre 2009 | editore=Australian Biological Resources Study | edizione=2 | accesso=27 agosto 2021}}</ref></small>
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Delle {{M|200000}} specie animali che si stima vivano in Australia, circa il 96% sono invertebrati. Sebbene non si conosca a pieno l'intera varietà della fauna invertebrata, il 90% degli [[Insecta|insetti]] e dei [[Mollusca|molluschi]] è considerato endemico.<ref name="Williams"/> Gli invertebrati occupano molte nicchie ecologiche e sono di fondamentale importanza nei vari ecosistemi come decompositori,<ref name=e492>{{cita|Egerton, 2005|p. 492}}.</ref> impollinatori e fonte di cibo.<ref name=e494495>{{cita|Egerton, 2005|pp. 494-495, 520, 553}}.</ref> Il gruppo più grande di invertebrati è quello degli insetti, che comprende il 75% delle specie animali conosciute d'Australia. Gli ordini di insetti più diversificati sono i [[Coleoptera|Coleotteri]], con {{M|28200}} specie di [[Coleoptera|scarabei]] e [[Curculionoidea|curculioni]],<ref name=e538>{{cita|Egerton, 2005|pp. 538-540}}.</ref> i [[Lepidoptera|Lepidotteri]], con {{M|20816}} specie di [[Farfalla|farfalle]] e [[Falena|falene]],<ref name=e545>{{cita|Egerton, 2005|p. 545}}.</ref> e gli [[Hymenoptera|Imenotteri]], con circa {{M|14800}} specie di [[Formicidae|formiche]], [[Anthophila|api]] e [[Apocrita|vespe]].<ref name="CSIRO-Entomology">{{cita web | autore=CSIRO Entomology | titolo=Insects and their allies | url=https://web.archive.org/web/20050615124728/http://www.ento.csiro.au/education/insects_allies.html}}</ref> L'ordine dei [[Diptera|Ditteri]], che include [[Diptera|mosche]] e [[Culicidae|zanzare]], è rappresentato da 7786 specie.<ref name=e542>{{cita|Egerton, 2005|pp. 542-543}}.</ref> L'ordine degli [[Hemiptera|Emitteri]], che comprende cimici, afidi e cicaline,<ref name=e533>{{cita|Egerton, 2005|pp. 533-535}}.</ref> conta 5650 specie; e quello degli [[Orthoptera|Ortotteri]], che comprende [[Caelifera|cavallette]], [[Gryllidae|grilli]] e [[Tettigoniidae|tettigonie]], 2827.<ref name=e528>{{cita|Egerton, 2005|pp. 528-531}}.</ref> Tra le specie introdotte che rappresentano una minaccia significativa per le specie autoctone ricordiamo la [[Vespula germanica|vespa di terra]],<ref name=e552>{{cita|Egerton, 2005|p. 552}}.</ref> la [[Solenopsis invicta|formica di fuoco]],<ref>{{cita web | url=http://entomology.ifas.ufl.edu/creatures/urban/ants/red_imported_fire_ant.htm#economic | titolo=Red imported fire ant – Solenopsis invicta | sito=Entomology.ifas.ufl.edu | accesso=24 luglio 2011 | urlmorto=sì | urlarchivio=https://web.archive.org/web/20160921211110/http://entomology.ifas.ufl.edu/creatures/urban/ants/red_imported_fire_ant.htm#economic}}</ref> la [[Anoplolepis gracilipes|formica pazza gialla]]<ref>{{cita web | autore=Synergy International Limited | url=http://www.issg.org/database/species/ecology.asp?si=110&fr=1&sts=&lang=EN | titolo=Issg Database: Ecology of Anoplolepis gracilipes | sito=Issg.org | accesso=24 luglio 2011 | urlmorto=sì | urlarchivio=https://web.archive.org/web/20120212184249/http://www.issg.org/database/species/ecology.asp?si=110&fr=1&sts=&lang=EN}}</ref> e l'[[Apis mellifera|ape europea]], che compete con le api autoctone.<ref name=e553>{{cita|Egerton, 2005|p. 553}}.</ref>
[[File:Green ants.jpg|left|thumb|In Australia sono state descritte 1275 tra specie e sottospecie di formiche.<ref>{{cita web | autore=S. Shattuck e N. Barnett | anno=2001 | url=https://web.archive.org/web/20080315185148/http://www.ento.csiro.au/science/ants/ants_in_australia.htm | titolo=Australian Ants Online | editore=CSIRO Entomology}}.</ref> Queste formiche tessitrici (''[[Oecophylla smaragdina]]'') sono diffuse nell'Australia tropicale e costruiscono nidi fatti di foglie.<ref name=e555>{{cita|Egerton, 2005|p. 555}}.</ref>]]
L'Australia presenta un'ampia varietà di [[Arachnida|aracnidi]], tra cui 78 famiglie di ragni<ref>{{cita libro | titolo=A Field Guide to Spiders of Australia | autore=Robert Whyte e Greg Anderson | editore=CSIRO Publishing | anno=2017 | isbn=9780643107076 | città=Clayton, Victoria, Australia}}</ref> con 79 specie abbastanza familiari da aver ricevuto un nome comune. Sono numerose le specie altamente velenose, tra cui il famigerato [[Atrax robustus|ragno dei cunicoli]] e altri migalomorfi, il cui [[Morsicatura di ragno|morso può essere letale]].<ref name=e563>{{cita|Egerton, 2005|p. 563}}.</ref> In passato si riteneva che il [[Latrodectus hasselti|ragno dalla schiena rossa]] fosse mortale, poiché si pensava che la mancanza di decessi dal 1956 fosse dovuta allo sviluppo di un antidoto, chema peròquesto si è dimostrato non migliore di un semplice placebo.<ref>{{cita libro | autore=Julian White | url=https://www.worldcat.org/oclc/794734478 | titolo=A clinician's guide to Australian venomous bites and stings: incorporating the updated CSL antivenom handbook | anno=2012 | editore=CSL Limited | isbn=978-0-646-57998-6 | città=Parkville, Vic. | oclc=794734478}}</ref><ref>{{cita pubblicazione | autore=Carol Booth | data=luglio-settembre 2008 | titolo=Along Came A Spider | url=http://www.australiangeographic.com.au/journal/along-came-a-spider.htm | urlmorto=sì | rivista=Australian Geographic | urlarchivio=https://web.archive.org/web/20091006070407/http://www.australiangeographic.com.au/journal/along-came-a-spider.htm}}</ref> Ci sono migliaia di specie di acari e zecche della sottoclasse [[Acarina]].<ref name=e557>{{cita|Egerton, 2005|p. 557}}.</ref> L'Australia ospita anche almeno 150 specie di [[Pseudoscorpionida|pseudoscorpioni]], dei quali si stima che ce ne siano altre 550 in attesa di essere descritte,<ref>{{cita web | titolo=Order SCORPIONES | url=https://biodiversity.org.au/afd/taxa/PSEUDOSCORPIONES | urlmorto=sì | urlarchivio=https://web.archive.org/web/20150304135805/http://www.biodiversity.org.au/afd/taxa/Scorpiones | sito=Australian Faunal Directory}}</ref> e almeno 17 generi di scorpioni con 120 specie.<ref>{{cita web | titolo=Names List for SCORPIONES | url=https://biodiversity.org.au/afd/taxa/SCORPIONES/names | urlmorto=sì | urlarchivio=https://web.archive.org/web/20180511100909/https://biodiversity.org.au/afd/taxa/SCORPIONES/names | sito=Australian Faunal Directory}}</ref>
 
Nella (sotto)classe degli [[Annelida|Anellidi]] [[Oligochaeta|Oligocheti]] ci sono molte famiglie di vermi acquatici e, tra i [[Verme|vermi]] terrestri nativi: gli [[Enchytraeidae|Enchitreidi]] («vermi da vaso») e lombrichi veri e propri delle famiglie [[Acanthodrilidae|Acantodrilidi]], [[Octochaetidae|Ottochetidi]] e [[Megascolecidae|Megascolecidi]]. A quest'ultima appartiene il più grande lombrico del mondo, il [[Megascolides australis|lombrico gigante del Gippsland]], presente solamente nel [[Gippsland]], una regione del [[Victoria (Australia)|Victoria]].<ref name=e518>{{cita|Egerton, 2005|p. 518}}.</ref> In media raggiunge gli 80 cm di lunghezza, ma sono stati trovati esemplari lunghi fino a 3,7 m.
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La grande famiglia dei [[Parastacidae|Parastacidi]] comprende 124 specie di gamberi d'acqua dolce australiani. Tra questi rientrano il gambero più piccolo del mondo, il [[Tenuibranchiurus|gambero di palude]], che non supera i 30 mm di lunghezza,<ref>{{cita web | autore=John W. Short | data=novembre 2000 | titolo=Freshwater Crayfish | url=http://www.qm.qld.gov.au/inquiry/factsheets/leaflet0057.pdf | urlmorto=sì | urlarchivio=https://web.archive.org/web/20090602082709/http://www.qm.qld.gov.au/inquiry/factsheets/leaflet0057.pdf | sito=Crustaceans 1 | editore=Queensland Museum}}</ref> e quello più grande, il [[Astacopsis gouldi|gambero d'acqua dolce gigante della Tasmania]],<ref name=e575>{{cita|Egerton, 2005|p. 575}}.</ref> che può raggiungere i 76 cm di lunghezza e i 4,5 kg di peso.<ref>{{cita web | url=http://www.environment.gov.au/biodiversity/threatened/publications/lobster.html | titolo=Tasmanian Giant Freshwater Lobster (''Astacopsis gouldi'') | editore=Department of the Environment, Water, Heritage and the Arts | data=9 febbraio 2007 | accesso=16 marzo 2010 | urlmorto=no | urlarchivio=https://web.archive.org/web/20100205071506/http://www.environment.gov.au/biodiversity/threatened/publications/lobster.html}}</ref> Ai gamberi del genere ''[[Cherax]]'' appartiene lo [[Cherax destructor|yabby comune]],<ref name=e575/> nonché tipiche specie da allevamento come il [[Cherax cainii|marron]] e il [[Cherax quadricarinatus|gambero dalle chele rosse del Queensland]]. In Australia si trovano anche varie specie del genere ''[[Engaeus]]'', note comunemente come gamberi di terra. Queste non sono interamente acquatiche, perché trascorrono la maggior parte della loro vita all'interno di tane sotterranee. L'Australia ospita sette specie di granchi d'acqua dolce del genere ''[[Austrothelphusa]]''. Questi granchi vivono nascosti lungo le rive dei corsi d'acqua e possono sigillare l'ingresso delle loro tane, sopravvivendo a diversi anni di siccità. I [[Anaspididae|gamberetti di montagna]] d'acqua dolce sono un peculiare gruppo estremamente primitivo, che presenta somiglianze con specie fossili risalenti a 200 milioni di anni fa.
[[File:Common clownfish.jpg|thumb|Un'[[Heteractis magnifica|anemone di mare magnifica]] della [[Grande barriera corallina|Grande Barriera Corallina]], con un [[Amphiprion ocellaris|pesce pagliaccio]].|left]]
Nelle acque australiane si trova un'enorme varietà di invertebrati marini; in particolare la [[Grande barriera corallina|Grande Barriera Corallina]] ospita gran parte di questa diversità. Gruppi particolarmente ben rappresentati sono i [[Porifera|Poriferi]] o spugne,<ref name=e497>{{cita|Egerton, 2005|p. 497}}.</ref> gli [[Cnidaria|Cnidari]] ([[Medusa (zoologia)|meduse]], [[Anthozoa|coralli]] e [[Actiniaria|anemoni di mare]]), gli [[Ctenophora|Ctenofori]],<ref name=e499>{{cita|Egerton, 2005|pp. 499-506}}.</ref> gli [[Echinodermata|Echinodermi]] ([[Echinoidea|ricci di mare]], [[Asteroidea|stelle marine]], [[Ophiuroidea|stelle serpentine]] e [[Holothuroidea|cetrioli di mare]]), i [[Brachiopoda|Brachiopodi]]<ref name=e597>{{cita|Egerton, 2005|pp. 597-606}}.</ref> e i Molluschi ([[Chiocciola|chiocciole]], [[Lumaca|lumache]], [[Patellogastropoda|patelle]], [[Teuthida|calamari]], [[Octopoda|polpi]], [[Cardiidae|cardi]], [[Ostreidae|ostriche]], [[Vongola|vongole]] e [[Polyplacophora|chitoni]]).<ref name=e494>{{cita|Egerton, 2005|p. 494}}.</ref> Tra gli invertebrati velenosi ricordiamo la [[Chironex fleckeri|vespa di mare]], il [[Hapalochlaena|polpo dagli anelli blu]],<ref name=ill>{{cita|Egerton, 2005|pp. 502, 596}}.</ref> e dieci specie di [[Conidae|conidi]], che possono causare insufficienza respiratoria e morte negli esseri umani.<ref name=ill/> La [[Acanthaster planci|stella di mare corona di spine]] di solito popola la barriera corallina a basse densità; tuttavia, in condizioni che non sono ancora ben comprese, può riprodursi fino a raggiungere una densità di popolazione insostenibile quando i coralli vengono divorati a una velocità superiore a quella con cui si rigenerano: ciò rappresenta una seria minaccia per la conservazione della barriera corallina. Altri invertebrati marini problematici comprendono sia specie autoctone come il riccio di mare viola e il riccio di mare bianco, che in alcuni casi, a causa dell'eccessivo sfruttamento dei loro predatori naturali, come [[Haliotidae|abaloni]] e [[Jasus edwardsii|aragoste]], possono impossessarsi di interi habitat marini, ricoprendo il fondale con migliaia di esemplari; che introdotte, come la [[Arcuatula senhousia|cozza asiatica]], la [[Perna canaliculus|cozza verde della Nuova Zelanda]], la [[Mytilopsis sallei|cozza a strisce nere]] e la [[Asterias amurensis|stella marina del Pacifico settentrionale]], che soppiantano tutti i molluschi autcoctoniautoctoni.
 
Ci sono molti crostacei marini unici nelle acque australiane. La classe più nota, a cui appartengono tutte le specie commestibili di crostsceicrostacei, è [[Malacostraca]]. Le calde acque dell'Australia settentrionale ospitano molte specie di crostacei [[Decapoda|decapodi]], come [[Brachyura|granchi]], [[Anomura|falsi granchi]], [[Paguroidea|paguri]], [[Palinuridae|aragoste]], [[Caridea|gamberetti]] e [[Dendrobranchiata|gamberi]]. I [[Peracarida|peracaridi]], quali [[Amphipoda|anfipodi]] e [[Isopoda|isopodi]], sono più diversificati nelle acque più fredde dell'Australia meridionale. Gruppi marini meno noti ma ben rappresentati sono le classi [[Remipedia]], [[Cephalocarida]], [[Branchiopoda]], [[Maxillopoda]] (cui appartengono i [[Cirripedia|cirripedi]], i [[Copepoda|copepodi]] e i [[Argulidae|pidocchi dei pesci]]) e [[Ostracoda]].<ref name=e569>{{cita|Egerton, 2005|pp. 569-570}}.</ref> Specie degne di nota sono il [[Pseudocarcinus gigas|granchio gigante della Tasmania]], la seconda specie di granchio più grande al mondo,<ref>{{cita web | url=https://www.britannica.com/EBchecked/topic/141462/crab/1592/Distribution-and-variety#ref=ref3637 | titolo=Crab (crustacean) :: Distribution and variety. – Britannica Online Encyclopedia | sito=Britannica.com | accesso=24 luglio 2011 | urlmorto=no | urlarchivio=https://web.archive.org/web/20110606120420/https://www.britannica.com/EBchecked/topic/141462/crab/1592/Distribution-and-variety#ref=ref3637}}</ref> che vive in acque profonde e può pesare fino a 13 kg,<ref name=e577>{{cita|Egerton, 2005|p. 577}}.</ref> e l'[[Panulirus cygnus|aragosta australiana]], che, come tutte le altre [[Palinuridae|aragoste]], è priva di chele.<ref name="e575"/>
 
== Specie invasive==