Risiedette nella Casa Assistenti, la residenza romana dell'[[Azione Cattolica]] che ospita anche i direttori degli uffici della [[Conferenza Episcopale Italiana]], fino alla sua morte avvenuta il 30 agosto [[2015]].
Le esequie si tennero il 1°º settembre alle ore 8 nella chiesa della Casa Assistenti e il 2 settembre alle ore 10 nella chiesa parrocchiale di [[Rima San Giuseppe]]. La salma venne poi tumulata nel cimitero locale.<ref>[http://www.diocesinovara.it/diocesi_di_novara/comunicazione/00002651_E__morto_a_Roma_mons__Pier_Franco_Pastore.html Comunicato]</ref><ref>[http://www.agi.it/cronaca/2015/08/30/news/vaticano_morto_mons_pastore_storico_segretario_comunicazioni-92902/ Articolo]</ref>